Поддерживаю идею HardWareMan добавить на форум ссылки с документацией, для разработчиков эмуляторов.

Общие сайты
http://hitmen.c02.at - Hitmen Home, куча документации на разные платформы.
http://www.romhacking.net/docs - тоже куча документации но преимущественно на старые системы.

NES
http://nesdev.parodius.com

GBA
http://www.gbadev.org
http://gbadev.narod.ru - несколько документов

PSX
http://psx.rules.org - Doomed/Padua. Документация на GPU, GTE, ассемблер SPASM

N64
http://dextrose.com - есть раздел по N64
http://n64dev.narod.ru - на русском о N64

GC
http://www.gcdev.com
http://freelink.org/gcdev
http://www.gc-linux.org/docs/yagcd.html - сборник документации на куб от Hitmen/groepaz

PS2
http://ps2dev.org

PS3
http://www.ibm.com/developer/power/cell - документация на CELL и PowerPC

Список первоначальный, постоянно будет пополняться.

У http://nesdev.parodius.com/ ещё есть такая удобная фича, как недельный архив сайта.

http://www.zophar.net/tech/ - документации на различные платформы и процессоры. В целом довольно старые.

http://emudocs.org/ - здесь в оснвоном собраны файлы с других сайтов. Неплохая подборка. Также и ссылки можно взять оттуда.

Домашние страницы:
http://fms.komkon.org/ - Marat Fayzullin
http://www.tripoint.org/kevtris/ - Kevin Horton
http://www.io.com/~nickb/ - Nick Bensema
http://cgfm2.emuviews.com/ - Charles MacDonald
http://www.trzy.org/ - Bart Trzynadlowski

6502
http://6502.org
http://users.telenet.be/kim1-6502/ - Software и Hardware мануалы по 6502 76-го года

Z80
http://z80.info

Atari
http://atarihq.com/
http://archives.atarimuseum.com/archive ... chdocs.htm
http://www.atariarchives.org/ - книги по Atari

SMS
http://www.smspower.org/

Sega Saturn + SMD
http://www.antime.org/
http://saturndev.emuvibes.com/

http://www.bripro.com/low/gamecom/index.php - Tiger Game.com
http://www.bripro.com/low/gameking/index.php - Game King

Где-то по Pokemon Mini сайт был, сходу не нашел.

Z80
http://sourceforge.net/projects/z80ex - Хороший эмулятор Z80, написанный нашим соотечественником (?).
Огромный плюс в том, что привязка его API соотв. "железному" варианту, то есть имитирует работу выводов микросхемы.
Утверждается, что есть поддержка всех недокументированных инструкций и режимов работы.

PowerPC
http://microlib.org/projects/ppc750sim - Эмулятор и симулятор процессора PowerPC 750, исходный код.

FPU
http://www.jhauser.us/arithmetic/SoftFloat.html - Библиотека для эмуляции процессоров с FPU стандарта IEEE-754.
Используется в Bochs, qemu.

Тогда прямой дорогой на http://www.fpgaarcade.com/ - там вплоть до сравнивания выводимого звука на осциллографе.

NES
http://nesdevwiki.org/wiki - Подробная информация об устройстве NES. Авторы нацеливаются на реверс-инжинеринг всех микросхем

http://www.emuwiki.com/ - Сайт открылся 1 Apr 2008. Активно обновляется.

Документики по Nintendo 64:

http://www.crazynation.org/N64/files/n64_patent_6239810.pdf - скан главного патента на Nintendo 64
http://www.crazynation.org/N64/files/cic_patent_6394905.pdf - патент на CIC
http://hcs64.com/files/RSPCOP0.pdf - RSP: регистры и DMA
http://hcs64.com/files/RDP_COMMANDS.pdf - аппаратные команды RDP
http://hcs64.com/files/n64-hw.dox - Lac's hardware docs 0.8 (не выходили официально)
http://www.yntproject.net/docs/R4400_Uman_book_Ed2.pdf - MIPS R4000 User's Manual (большая книга)
http://www.zophar.net/documents/n64/n64-cpu.html - R4300 Data Sheet 0.3
http://n64.devkit.sdk.intro.functions.googlepages.com/ - N64 Function Reference Manual и др.

ed2k://|file|Nintendo%2064%20Online%20M ... 0Kit%20SDK)%20(allman51eng).zip|36831135|FB5752A85A6F3729268775EBC6F0CEF0|h=M6ZAOVP5BQGXCLA726RHKMU4USOYAHVT|/

- N64 Programming Manual и др.

+ исходники MAME, особенно rsp.c и video\n64.c
+ девкиты в осле